More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3796 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  86.78 
 
 		 367 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  86.35 
 
 		 360 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  84.02 
 
 		 369 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  79.1 
 
 		 354 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  74.86 
 
 		 343 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  76.94 
 
 		 374 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  73.78 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  61.2 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  57.53 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  59.67 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  56.99 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  58.24 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  55.12 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  56.62 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  57.81 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  58.59 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  58.73 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  58.01 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  57.75 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  53.46 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  54.21 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  56.62 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  54.08 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  52.35 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  52.5 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  52.5 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  54.24 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  53.48 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  49.18 
 
 		 323 aa  348  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  48.74 
 
 		 323 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  48.74 
 
 		 323 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  49.59 
 
 		 323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  49.32 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  48.44 
 
 		 323 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  46.96 
 
 		 323 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  42.54 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  47.3 
 
 		 375 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  43.79 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  41.53 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  44.11 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  41.71 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  45.11 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  40.28 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  45.9 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  41.8 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  61.54 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  40.17 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  40.11 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  57.35 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  58.17 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  57.35 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  39.22 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  56.4 
 
 		 460 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  38.61 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.66 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.66 
 
 		 316 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.1 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  56.46 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.1 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.54 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.1 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.54 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  56.25 
 
 		 449 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.54 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  40.1 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  56.25 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  56.25 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  37.82 
 
 		 316 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  39.39 
 
 		 351 aa  242  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  39.12 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  42.98 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  40.28 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  41.35 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  41.39 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  41.94 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  40.38 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  41.89 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  38.28 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  39.62 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  39.94 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  39.11 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  41.05 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  41.35 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  38.02 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  39.44 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  41.62 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  40.56 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  37.57 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.4 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  40.28 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  40.05 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  40.44 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  40.6 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  38.46 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  40.33 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  38.8 
 
 		 387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>