224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3736 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  100 
 
 		 348 aa  716    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  68.1 
 
 		 350 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  66.67 
 
 		 350 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  61.74 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  60.06 
 
 		 349 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  59.77 
 
 		 349 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  57.51 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  45.51 
 
 		 349 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  46.97 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.48 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  46.65 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  46.53 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  47.43 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  45.04 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  44 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  44.51 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  44.38 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.13 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  42.27 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  41.57 
 
 		 343 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  43.73 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  41.08 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  43.73 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  42.77 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  45.16 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  44.84 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  43.09 
 
 		 350 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  41.8 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  42.57 
 
 		 343 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  43.84 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  45.16 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  44.22 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  43.27 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  37.61 
 
 		 346 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  41.96 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  39.83 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  42.31 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  41.8 
 
 		 355 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  39.13 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  41.35 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  41.99 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  41.48 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  42.12 
 
 		 346 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  41.99 
 
 		 346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  41.48 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  41.48 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  41.9 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  43.55 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  39 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  41.48 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  43.55 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  40.52 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  41.4 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  40.76 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  36.73 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.95 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  40.41 
 
 		 352 aa  225  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  39.37 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  36.73 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  44.01 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  42.12 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  42.12 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  39.77 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  39.71 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  39.83 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  38.3 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  38.3 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  38.3 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  40.88 
 
 		 368 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  40.84 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  40.94 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  37.21 
 
 		 359 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.26 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  40.52 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  37.29 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  37.9 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  38.35 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  38.35 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  38.07 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  38.15 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  37.5 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  41.48 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  37.01 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  38.33 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  40.4 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  36.73 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  34.5 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  35.84 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  32.37 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  33.72 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  30.75 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  34.76 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  38.43 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  27.27 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  28.41 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  28.41 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  28.16 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  31.09 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  30.92 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>