83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3721 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  59.87 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  57.89 
 
 		 153 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  57.89 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  50.33 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  46.05 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  45.07 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  44.29 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  48.03 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  42.67 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  42 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  45.77 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  43.14 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  44.08 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  40.29 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  38.03 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  39.2 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  38.3 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  40.71 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  38.62 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  44.72 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  35.71 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  35.25 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  35.71 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  37.33 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  35.97 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  37.86 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  32.17 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.34 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.34 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  32.26 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  33.55 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  32.26 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  32.26 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  30.83 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  32.26 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  32.26 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  30.53 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  36.17 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  27.33 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  31.3 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  30.34 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  27.27 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  26.45 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  30.34 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  33.99 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  26.81 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  31.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  31.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  31.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.28 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  31.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  25.34 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  27.4 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  29.05 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  30.14 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  25.52 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  26.95 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  22.13 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  24.84 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0842  protein of unknown function DUF107  25 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  28.68 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  26.21 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  23.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  28.26 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>