More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3667 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 608 aa  1214    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  63.62 
 
 		 681 aa  700    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  63.97 
 
 		 599 aa  703    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  58.01 
 
 		 619 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.86 
 
 		 627 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  72.67 
 
 		 600 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  70.57 
 
 		 597 aa  800    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  60.35 
 
 		 619 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  60.59 
 
 		 641 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  71.91 
 
 		 600 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.66 
 
 		 632 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.56 
 
 		 639 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.86 
 
 		 629 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  56.71 
 
 		 616 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  63.94 
 
 		 601 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  60 
 
 		 634 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  63.05 
 
 		 608 aa  705    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  59.48 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  53.78 
 
 		 606 aa  626  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.65 
 
 		 614 aa  625  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  58.87 
 
 		 631 aa  618  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  58.86 
 
 		 618 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  58.86 
 
 		 618 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.89 
 
 		 605 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  59.48 
 
 		 600 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  60.17 
 
 		 605 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  52.25 
 
 		 650 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.42 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.17 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  51.03 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.31 
 
 		 608 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  50.52 
 
 		 590 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.68 
 
 		 628 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  51.12 
 
 		 606 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50 
 
 		 595 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.09 
 
 		 597 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.3 
 
 		 597 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.77 
 
 		 597 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.17 
 
 		 589 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  45.69 
 
 		 586 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  49.48 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.97 
 
 		 586 aa  525  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  45 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.37 
 
 		 603 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  46.62 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  50 
 
 		 594 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.03 
 
 		 605 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  49.4 
 
 		 602 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.08 
 
 		 580 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.66 
 
 		 595 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.22 
 
 		 601 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.83 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.36 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  44.89 
 
 		 589 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  48.05 
 
 		 597 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.85 
 
 		 587 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.73 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  46.06 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  48.02 
 
 		 616 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.76 
 
 		 589 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.99 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.73 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.31 
 
 		 592 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  48.77 
 
 		 588 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1659  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.73 
 
 		 600 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0888  ABC transporter related  49.16 
 
 		 600 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0973  ABC transporter related  49 
 
 		 600 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.32 
 
 		 568 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.69 
 
 		 582 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.48 
 
 		 590 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.4 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.89 
 
 		 606 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.07 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.69 
 
 		 595 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  43 
 
 		 598 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.96 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.13 
 
 		 613 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.31 
 
 		 637 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.82 
 
 		 625 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  44.81 
 
 		 643 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.43 
 
 		 620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1279  ABC transporter-related protein  49.74 
 
 		 612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173874  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  42.88 
 
 		 614 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 623 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.02 
 
 		 617 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  43.52 
 
 		 598 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.4 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4256  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  48.99 
 
 		 588 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.12 
 
 		 634 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.04 
 
 		 634 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.87 
 
 		 644 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.87 
 
 		 644 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  41.11 
 
 		 603 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  39.49 
 
 		 594 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 601 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  41.92 
 
 		 597 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.89 
 
 		 593 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  42.58 
 
 		 598 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  43.52 
 
 		 601 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>