More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3570 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  100 
 
 		 332 aa  683    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  78.55 
 
 		 332 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  77.64 
 
 		 332 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  76.44 
 
 		 332 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  75.53 
 
 		 333 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  73.72 
 
 		 336 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  73.11 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  71.9 
 
 		 332 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  71.9 
 
 		 332 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  71.9 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  70.69 
 
 		 332 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  69.79 
 
 		 334 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  70.82 
 
 		 332 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  67.98 
 
 		 334 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  68.58 
 
 		 334 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  67.27 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  68.98 
 
 		 335 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  61.93 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  62.92 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  63.83 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.93 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.63 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  62.58 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  61.96 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  62.77 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  59.57 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  61.23 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  56.15 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  58.93 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  57.83 
 
 		 333 aa  397  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  55.96 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  56.23 
 
 		 370 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.23 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  55.74 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  59.76 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.9 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.93 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  56.5 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  55.03 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  54.78 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  58.48 
 
 		 333 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  57.23 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  55.42 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  58.79 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  55.62 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  54.21 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  50.98 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  56.89 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  55.99 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  54.62 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  53.61 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  56.77 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.18 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.47 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  55.96 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.49 
 
 		 376 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  53.93 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.22 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  52.71 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51.84 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  52.71 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 395 aa  362  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  53.65 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.01 
 
 		 354 aa  361  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 361 aa  360  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  50.54 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.51 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  55.49 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  53.98 
 
 		 374 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  51.23 
 
 		 372 aa  358  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.23 
 
 		 369 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  54.32 
 
 		 381 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.81 
 
 		 362 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  55.59 
 
 		 331 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  56.33 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 		 372 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  52.53 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  50.14 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.73 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.27 
 
 		 352 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.96 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  53.76 
 
 		 351 aa  355  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  51 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.79 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  52.66 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.68 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  51.68 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.96 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  53.01 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  51.42 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>