More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3392 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  63.52 
 
 		 710 aa  929    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  82.02 
 
 		 653 aa  1078    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  100 
 
 		 695 aa  1432    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  70.1 
 
 		 741 aa  1029    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  71.11 
 
 		 800 aa  1038    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  67.57 
 
 		 774 aa  1021    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3020  Rhs element Vgr protein  52.6 
 
 		 738 aa  608  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.988422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  34.19 
 
 		 689 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.09 
 
 		 689 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.46 
 
 		 741 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  32.69 
 
 		 741 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.57 
 
 		 683 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.39 
 
 		 683 aa  342  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 741 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  30.66 
 
 		 706 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.08 
 
 		 643 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  333  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  31.47 
 
 		 618 aa  327  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  36.43 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  36.07 
 
 		 616 aa  324  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  36.3 
 
 		 615 aa  323  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.35 
 
 		 692 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  32.25 
 
 		 692 aa  321  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  31.22 
 
 		 778 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  31.28 
 
 		 774 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.39 
 
 		 754 aa  313  6.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  34.71 
 
 		 619 aa  313  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 669 aa  313  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  33.57 
 
 		 921 aa  312  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05480  Vgr-related protein  36.73 
 
 		 760 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  30.94 
 
 		 794 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  31.83 
 
 		 788 aa  310  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  30.55 
 
 		 748 aa  310  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  32.06 
 
 		 754 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.04 
 
 		 709 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  35.35 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  31.42 
 
 		 907 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  34.85 
 
 		 617 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  34.85 
 
 		 617 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  34.3 
 
 		 655 aa  306  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  34.9 
 
 		 656 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  34.62 
 
 		 618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  36.25 
 
 		 668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 		 703 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  29.53 
 
 		 734 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  34 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  30.8 
 
 		 792 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  33.87 
 
 		 619 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  30.99 
 
 		 771 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 734 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  30.04 
 
 		 731 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 734 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 734 aa  300  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 734 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 734 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 734 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  30.21 
 
 		 730 aa  300  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  30.69 
 
 		 755 aa  300  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  29.31 
 
 		 771 aa  299  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  34.41 
 
 		 678 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 734 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  37.72 
 
 		 668 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 		 731 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  32.98 
 
 		 682 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  33.98 
 
 		 617 aa  296  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  30.72 
 
 		 756 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  34.15 
 
 		 699 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  31.7 
 
 		 767 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  30.55 
 
 		 757 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  31.7 
 
 		 767 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  33.73 
 
 		 694 aa  294  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  34.97 
 
 		 668 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  32.63 
 
 		 678 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  33.69 
 
 		 678 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 655 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  33.16 
 
 		 572 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 680 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0646  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 700 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  33.04 
 
 		 641 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  33.28 
 
 		 642 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  31.48 
 
 		 777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  30.13 
 
 		 785 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  33.7 
 
 		 694 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  33.14 
 
 		 684 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 706 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 706 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 680 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 706 aa  283  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  32.45 
 
 		 646 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 783 aa  280  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  29.54 
 
 		 712 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  31.44 
 
 		 616 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>