More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3321 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  54.55 
 
 		 799 aa  803    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51.98 
 
 		 779 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  54.27 
 
 		 812 aa  765    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  53.22 
 
 		 799 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.87 
 
 		 788 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  55.06 
 
 		 792 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.52 
 
 		 796 aa  795    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  66.1 
 
 		 780 aa  1012    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.14 
 
 		 792 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.88 
 
 		 787 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.75 
 
 		 787 aa  738    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  53.82 
 
 		 839 aa  779    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  81.08 
 
 		 779 aa  1281    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  47 
 
 		 772 aa  650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  56.42 
 
 		 793 aa  841    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.88 
 
 		 787 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  53.82 
 
 		 797 aa  782    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.56 
 
 		 788 aa  829    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  50.3 
 
 		 825 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  54.23 
 
 		 784 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.95 
 
 		 764 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  56.14 
 
 		 787 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.71 
 
 		 785 aa  813    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.95 
 
 		 814 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.18 
 
 		 825 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.96 
 
 		 787 aa  800    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  49.45 
 
 		 812 aa  736    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.82 
 
 		 799 aa  777    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.07 
 
 		 808 aa  771    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.09 
 
 		 787 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  65.8 
 
 		 784 aa  1013    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.27 
 
 		 801 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  54.03 
 
 		 802 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.22 
 
 		 799 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.67 
 
 		 788 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.36 
 
 		 788 aa  720    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.55 
 
 		 825 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.75 
 
 		 787 aa  738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  52.54 
 
 		 797 aa  738    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  60.1 
 
 		 779 aa  885    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  51.44 
 
 		 856 aa  759    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  56.55 
 
 		 783 aa  816    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  47.67 
 
 		 800 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.58 
 
 		 794 aa  913    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  51.61 
 
 		 782 aa  748    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.75 
 
 		 787 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  71.39 
 
 		 777 aa  1143    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  54.61 
 
 		 787 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.22 
 
 		 799 aa  784    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  55.2 
 
 		 781 aa  815    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.91 
 
 		 767 aa  664    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.75 
 
 		 800 aa  767    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  50.72 
 
 		 784 aa  749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  81.08 
 
 		 779 aa  1278    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  71.74 
 
 		 777 aa  1137    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  71.13 
 
 		 781 aa  1118    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.43 
 
 		 788 aa  829    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  54.95 
 
 		 787 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  54.41 
 
 		 799 aa  801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  53.29 
 
 		 798 aa  784    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  54.87 
 
 		 787 aa  804    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.75 
 
 		 787 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  100 
 
 		 781 aa  1613    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.74 
 
 		 787 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.56 
 
 		 784 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.75 
 
 		 787 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  65.41 
 
 		 770 aa  1050    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.9 
 
 		 801 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  53.59 
 
 		 830 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.18 
 
 		 828 aa  735    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.15 
 
 		 801 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54 
 
 		 797 aa  778    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  73.58 
 
 		 785 aa  1194    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.42 
 
 		 818 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.75 
 
 		 816 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  52.77 
 
 		 797 aa  798    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.91 
 
 		 823 aa  731    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.13 
 
 		 799 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  63.53 
 
 		 793 aa  939    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.76 
 
 		 804 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  45.58 
 
 		 767 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  40.74 
 
 		 1363 aa  541  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  41.56 
 
 		 1350 aa  535  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  39.21 
 
 		 769 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  37.45 
 
 		 1387 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  31.08 
 
 		 730 aa  308  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.98 
 
 		 754 aa  290  9e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5518  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.34 
 
 		 940 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5751  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.2 
 
 		 940 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.373125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  26.86 
 
 		 715 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2835  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, alpha subunit  27.63 
 
 		 797 aa  230  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.96 
 
 		 782 aa  229  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2136  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.02 
 
 		 768 aa  227  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.66 
 
 		 774 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.63 
 
 		 757 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.27 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3026  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.8 
 
 		 765 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.214024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0826  Xanthine dehydrogenase  26.8 
 
 		 765 aa  220  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0842  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.8 
 
 		 765 aa  220  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3191  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.8 
 
 		 765 aa  220  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>