246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3262 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  100 
 
 
154 aa  320  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  82.47 
 
 
154 aa  273  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  81.17 
 
 
154 aa  271  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  82.47 
 
 
154 aa  268  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2044  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.03 
 
 
154 aa  244  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1144  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.2 
 
 
155 aa  242  1e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.594767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.55 
 
 
155 aa  243  1e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1183  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.2 
 
 
155 aa  242  1e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2779  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.71 
 
 
158 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.37 
 
 
158 aa  238  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1742  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.61 
 
 
158 aa  237  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.43 
 
 
154 aa  236  6e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2817  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.05 
 
 
158 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153581  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.83 
 
 
154 aa  234  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2482  7-cyano-7-deazaguanine reductase  69.62 
 
 
158 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.245028  normal  0.291037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1828  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.22 
 
 
158 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  69.48 
 
 
154 aa  231  2e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  1.04861e-05  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1463  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.83 
 
 
152 aa  230  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.13 
 
 
162 aa  230  7e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2906  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.41 
 
 
153 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61276  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  73.97 
 
 
159 aa  229  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.41 
 
 
153 aa  227  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.41 
 
 
153 aa  227  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.22 
 
 
150 aa  226  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3756  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.81 
 
 
151 aa  226  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3217  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.11 
 
 
158 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5893  7-cyano-7-deazaguanine reductase  71.53 
 
 
150 aa  224  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  70.83 
 
 
150 aa  221  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3774  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.75 
 
 
150 aa  221  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.97 
 
 
156 aa  220  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0442  7-cyano-7-deazaguanine reductase  67.11 
 
 
153 aa  219  1e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  63.64 
 
 
174 aa  216  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.71 
 
 
153 aa  215  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2551  7-cyano-7-deazaguanine reductase  65.73 
 
 
166 aa  207  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.914539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1060  7-cyano-7-deazaguanine reductase  64.29 
 
 
153 aa  206  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.356271  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.86 
 
 
155 aa  171  3e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.63 
 
 
99 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.96 
 
 
163 aa  133  1e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.26 
 
 
166 aa  132  2e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  130  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.96 
 
 
166 aa  130  7e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.96 
 
 
166 aa  130  7e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.18 
 
 
154 aa  129  2e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.20055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.99367e-14 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
165 aa  129  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.23 
 
 
165 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.82 
 
 
180 aa  126  9e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.85 
 
 
166 aa  124  4e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.78 
 
 
165 aa  119  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.65 
 
 
141 aa  117  4e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.65 
 
 
141 aa  117  4e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1644  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.27 
 
 
155 aa  112  1e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48 
 
 
139 aa  113  1e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2025  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.94 
 
 
165 aa  112  2e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0305179  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.41 
 
 
144 aa  112  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.18 
 
 
188 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.83 
 
 
167 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  49.59 
 
 
143 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1809  GTP cyclohydrolase I-related enzyme  47.46 
 
 
161 aa  109  2e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.08 
 
 
122 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.08 
 
 
122 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  49.49 
 
 
129 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.26 
 
 
159 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  47.66 
 
 
139 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  43.81 
 
 
128 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.16 
 
 
139 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.23 
 
 
129 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.15 
 
 
118 aa  99  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.47 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1886  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.67 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.8 
 
 
122 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.93 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1181  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.69 
 
 
128 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  45.1 
 
 
118 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.86 
 
 
129 aa  94  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.28 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0579  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.63 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.45 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0561  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0006  NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase (NADPH-dependent nitrile oxidoreductase)  44.21 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1759  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42 
 
 
116 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0282  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.16 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.290856  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0840  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.57 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000632254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.88 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2643  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.99 
 
 
131 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0608  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1627  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1849  response regulator  37.61 
 
 
198 aa  85.9  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0685  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0991  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0005  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.43 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.83 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.780472  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0514  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
118 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>