More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3260 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  100 
 
 
168 aa  337  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  60.74 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  59.88 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0826  putative acetyltransferase  48.41 
 
 
166 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  33.94 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06852  hypothetical protein  31.21 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  40.87 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  33.95 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  43.64 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  43.64 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  39.64 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  36.21 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.167561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.13 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  32.64 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001236  histone acetyltransferase HPA2  29.7 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.993571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2470  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000909286  normal  0.30524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  40.19 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1002  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1117  acetyltransferase, GNAT family  35.16 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  29.52 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  36.04 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  36.04 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4189  acetyltransferase, GNAT family  37.72 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248105  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  38.18 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  36.45 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  38.18 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000015157  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  28.22 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  35.51 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  29.76 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  29.76 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5452  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  35.51 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0999  acetyltransferase  33.61 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3187  acetyltransferase  42.72 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1163  acetyltransferase, GNAT family  35.71 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1967  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
243 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0649  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
266 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.13747  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0377  acetyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.709528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2140  acetyltransferase  32.16 
 
 
217 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.140339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3484  acetyltransferase  42.72 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.596039  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0831  putative acetyltransferase  39.08 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.591066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0512  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
253 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  39.09 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  39.66 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0741  putative acetyltransferase  39.08 
 
 
197 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.871349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  39.02 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1778  acetyltransferase  41.75 
 
 
183 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357267  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  39.66 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  41.38 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  39.66 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3488  acetyltransferase, gnat family  42.72 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
163 aa  61.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000258649  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  41.75 
 
 
183 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3274  acetyltransferase  42.72 
 
 
181 aa  61.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.959565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3471  acetyltransferase, gnat family  41.75 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2225  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00859735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2168  acetyltransferase, GNAT family  38.18 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  37.8 
 
 
169 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2447  acetyltransferase  32.37 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000832578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2248  acetyltransferase  32.37 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000532423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2181  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.37 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000136101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2212  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2412  acetyltransferase  32.37 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  37.8 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  41.28 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4699  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2430  acetyltransferase, GNAT family  32.37 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.32582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2378  acetyltransferase, GNAT family  35.4 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2168  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.65 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2511  acetyltransferase, GNAT family  32.37 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.037927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2953  acetyltransferase, GNAT family  31.65 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.323576  hitchhiker  0.000000100965 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  38.79 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>