277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3227 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  73.17 
 
 
210 aa  313  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  72.68 
 
 
216 aa  307  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  70.73 
 
 
216 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  61.43 
 
 
211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  58.57 
 
 
207 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  68.1 
 
 
168 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  68.1 
 
 
168 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  56.18 
 
 
214 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  55 
 
 
221 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  59.88 
 
 
211 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  50.95 
 
 
223 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  50.24 
 
 
221 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  60.13 
 
 
220 aa  188  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  59.01 
 
 
225 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  59.26 
 
 
221 aa  184  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 
198 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
226 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 
227 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  55.42 
 
 
239 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
242 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 
226 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 
227 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 
210 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 
221 aa  168  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
243 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  52.44 
 
 
244 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 
233 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
216 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  51.83 
 
 
222 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  54.27 
 
 
233 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  49.41 
 
 
202 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  52.91 
 
 
235 aa  161  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 
234 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
207 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 
234 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  50.92 
 
 
214 aa  158  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  50 
 
 
226 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
243 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 
235 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 
194 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 
228 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 
228 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  47.49 
 
 
235 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 
228 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  50 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  48 
 
 
195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.85 
 
 
427 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  42.44 
 
 
238 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 
195 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 
195 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 
195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.28 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.28 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.24 
 
 
347 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.28 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.28 
 
 
333 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.28 
 
 
483 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
195 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  49.4 
 
 
227 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.28 
 
 
427 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  43.98 
 
 
190 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  44.97 
 
 
197 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  46.5 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  47 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
189 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
204 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  47.17 
 
 
267 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.21 
 
 
285 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 
241 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
199 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
189 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
197 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  42.94 
 
 
202 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  41.24 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  41.24 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  41.24 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  40.68 
 
 
192 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  42.24 
 
 
192 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
189 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  38.1 
 
 
199 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
231 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.52 
 
 
199 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  40.72 
 
 
192 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>