56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3124 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  882    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  39.71 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  39.81 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  37.94 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  37.65 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  36.49 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  35.82 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  35.66 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  30.98 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  31.8 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  33.61 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  28.99 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  29.98 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  27.82 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  28.06 
 
 		 721 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  31.56 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  30.41 
 
 		 595 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  31.27 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  31.56 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  29.26 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  29.36 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  29.59 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  32.31 
 
 		 777 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  30.07 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  30.07 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  29.79 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  29.12 
 
 		 345 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  30.84 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  30.84 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  29.83 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  30.22 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  29.7 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  29.38 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  27.92 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 		 632 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  27.87 
 
 		 530 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  27.6 
 
 		 831 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  28.32 
 
 		 416 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  29.03 
 
 		 746 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  31.31 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  26.7 
 
 		 514 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  28.53 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  29.04 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  28.86 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  29.26 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  29.29 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  28.99 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  30.26 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  27.34 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.4 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  27.19 
 
 		 1892 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  26.3 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>