More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3099 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  100 
 
 		 301 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.32 
 
 		 303 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.97 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  60.84 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.37 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.36 
 
 		 297 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.69 
 
 		 297 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.19 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.75 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.83 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.83 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  50 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.42 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.24 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.64 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.4 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.05 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  50 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.06 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.64 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.56 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.64 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.95 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.66 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.92 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.92 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.81 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.92 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.92 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.22 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.88 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.49 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.83 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.12 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.26 
 
 		 295 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.21 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.11 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  50.93 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.01 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.51 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.53 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.37 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.46 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.9 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.9 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.22 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.46 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.28 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.33 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  41.55 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.56 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.62 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.33 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.78 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.15 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.73 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.24 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.74 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.73 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.74 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.74 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.91 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.03 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.05 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.68 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.36 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.68 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  39.93 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.2 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.43 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.46 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.32 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 299 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  43.75 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>