22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3060 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  83.73 
 
 		 215 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  42.6 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  38.25 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  42.75 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  33.09 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  38.35 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  35.66 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  38.13 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  36.61 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  33.78 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  38.58 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  38.58 
 
 		 154 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  30.81 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  30.81 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  35.88 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  48 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  48 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  39.39 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  34.92 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>