25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3025 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  83.73 
 
 		 217 aa  351  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  48.48 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  40.18 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  39.57 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  37.78 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  33.81 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  41.04 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  38.85 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  34.72 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  34.46 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  39.37 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  38.58 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  30.07 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  30.07 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  35.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  41.18 
 
 		 146 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  35.38 
 
 		 133 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  32.84 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  48 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  48 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5255  normal  0.136566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>