27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3006 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  82.4 
 
 		 517 aa  845    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1043    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  53.81 
 
 		 543 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  53.81 
 
 		 543 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  51.05 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  51.34 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  38.97 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  39.11 
 
 		 519 aa  309  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  39.11 
 
 		 519 aa  309  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  37.25 
 
 		 530 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  37.74 
 
 		 582 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  34.76 
 
 		 584 aa  250  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  36.9 
 
 		 523 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  31.57 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  31.44 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 538 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  33.95 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  33.42 
 
 		 523 aa  183  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  34.22 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  28.09 
 
 		 537 aa  143  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  26.01 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  26.89 
 
 		 524 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  26.98 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  29.29 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  24.67 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  22.69 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  28.86 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>