More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2812 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2812  serine protease  100 
 
 
528 aa  1050    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  63.03 
 
 
588 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  62.13 
 
 
578 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  60.29 
 
 
502 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  53.15 
 
 
524 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  52.99 
 
 
520 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  52.96 
 
 
524 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  56.44 
 
 
498 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  53.63 
 
 
471 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  53.7 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  52.88 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  53.97 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  52.7 
 
 
496 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  51.57 
 
 
500 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  51.59 
 
 
522 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  54.16 
 
 
497 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  50.41 
 
 
523 aa  458  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  50.94 
 
 
501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  51.85 
 
 
511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  51.03 
 
 
498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  50.96 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  51.65 
 
 
511 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  52.45 
 
 
497 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  50.83 
 
 
499 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  50.43 
 
 
508 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  52.13 
 
 
498 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  48.94 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  50.22 
 
 
501 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  49.68 
 
 
487 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  49.25 
 
 
493 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  49.25 
 
 
506 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  47.12 
 
 
515 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  47.56 
 
 
514 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  45.93 
 
 
535 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  47.75 
 
 
499 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  42.14 
 
 
491 aa  362  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  45.45 
 
 
459 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.62 
 
 
513 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.62 
 
 
513 aa  347  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.36 
 
 
489 aa  345  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  43.36 
 
 
524 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  40.51 
 
 
529 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  37.84 
 
 
520 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.27 
 
 
476 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.98 
 
 
485 aa  333  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  44.81 
 
 
491 aa  329  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  41.25 
 
 
526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.66 
 
 
509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.03 
 
 
464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  38.64 
 
 
517 aa  326  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  43.34 
 
 
527 aa  326  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  42.72 
 
 
502 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  40.72 
 
 
520 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  45.18 
 
 
496 aa  322  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  45.06 
 
 
537 aa  322  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.23 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.2 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  40.45 
 
 
523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.63 
 
 
497 aa  321  3e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.34 
 
 
475 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  41.95 
 
 
501 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.33 
 
 
466 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  42.04 
 
 
523 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  44.67 
 
 
496 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  42.57 
 
 
506 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  41.24 
 
 
528 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  41.69 
 
 
505 aa  316  6e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  45.09 
 
 
496 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.73 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  41.36 
 
 
528 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  44.19 
 
 
503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  44.19 
 
 
503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.65 
 
 
504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  44.08 
 
 
527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  44.08 
 
 
527 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  41.06 
 
 
501 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.42 
 
 
500 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.71 
 
 
508 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  45.08 
 
 
464 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.31 
 
 
475 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  42.79 
 
 
516 aa  309  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  44.19 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.14 
 
 
501 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  37.91 
 
 
518 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.27 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.7 
 
 
483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.98 
 
 
477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.7 
 
 
483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.04 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.22 
 
 
482 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.54 
 
 
492 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.2 
 
 
479 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.23 
 
 
458 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.54 
 
 
477 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.51 
 
 
481 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  41.11 
 
 
473 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.59 
 
 
474 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  37.7 
 
 
483 aa  299  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  41.32 
 
 
525 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  40.66 
 
 
474 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>