More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2809 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  81.02 
 
 		 296 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  79.66 
 
 		 296 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  77.89 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  67.35 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  66.67 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  67.12 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  62.46 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  59.8 
 
 		 297 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  58.76 
 
 		 291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  57.29 
 
 		 296 aa  325  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  56.61 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  57.43 
 
 		 292 aa  315  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  55.97 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  56.46 
 
 		 296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  56.42 
 
 		 297 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  58.72 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  56.7 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  55.7 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  57.63 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  55.89 
 
 		 298 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  55.59 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  55.78 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  55.07 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  53.85 
 
 		 291 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  53.54 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  62.18 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  63.23 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  52.86 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  55.07 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  52.51 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  55.6 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  51.15 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.28 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  44.07 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  41.84 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.78 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  49.5 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.65 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  45.56 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  48.21 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  47.77 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.39 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  47.58 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  48.65 
 
 		 404 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.23 
 
 		 404 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 		 404 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47.87 
 
 		 435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  40.88 
 
 		 415 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  47.19 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.77 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.78 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  47.09 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 429 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.1 
 
 		 432 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  48.33 
 
 		 236 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.29 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  38.83 
 
 		 406 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  47.78 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 		 236 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.26 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  42.74 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.74 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  44.25 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 		 419 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  48.28 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  48.28 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  48.28 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  48.28 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.55 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  42.35 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  47.78 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.29 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  47.78 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  44.93 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  42.11 
 
 		 429 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.29 
 
 		 420 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  44.78 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 		 410 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  43.3 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  41.9 
 
 		 210 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  41.94 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  42.04 
 
 		 405 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>