99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2771 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  100 
 
 		 311 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  76.45 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  40.59 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  40.53 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  39 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  38.72 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  38.75 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  38.67 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  30.54 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  28.16 
 
 		 383 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  29.24 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  29.39 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  24.58 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  26.04 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  27.12 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  28.74 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  26.18 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.17 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  22.54 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.03 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  26.09 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  26.84 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  25.23 
 
 		 421 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  25.14 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  26.32 
 
 		 385 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  25.45 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  22.88 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25.72 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.25 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  28.51 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  24.23 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.12 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26.02 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  26.62 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  27.02 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  26.62 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  25.91 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  28.39 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  24.46 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.77 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  23.4 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  26.29 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  26.29 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  28.5 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  28 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  26.51 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.51 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  23.46 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  22.73 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  25.3 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  22.22 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.46 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  26.42 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  25 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  24.91 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  22.01 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  26.27 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.96 
 
 		 431 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.17 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  26.86 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  21.52 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  24.06 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.02 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  25.35 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  24.92 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  27.44 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 200 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  24.07 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  24.02 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.91 
 
 		 391 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  24.67 
 
 		 416 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  21.47 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.31 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  27.94 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.31 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  21.47 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  24.19 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  27.65 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  25.97 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  25 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  26.52 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.39 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  26.29 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  22.12 
 
 		 384 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>