More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2751 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2751  transposase  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  85.39 
 
 		 96 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  76.04 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  79.79 
 
 		 97 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  71.28 
 
 		 97 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  71.28 
 
 		 97 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  76.47 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  45.16 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  45.16 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  45.16 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  50.56 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  49.47 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  49.47 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  47.83 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  43.96 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  45.36 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  45.36 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  41.49 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  46.88 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  45.26 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  36.17 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  39.36 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  40.43 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  40.43 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  40.43 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  40.43 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  43.01 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  40.43 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  44.68 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  39.36 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  37.5 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  37.5 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>