202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2639 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  100 
 
 		 499 aa  997    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  49.8 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  65.84 
 
 		 208 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  66.01 
 
 		 208 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  65.35 
 
 		 208 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  66.01 
 
 		 208 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  65.35 
 
 		 208 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  66.67 
 
 		 208 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  66.15 
 
 		 208 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  66.01 
 
 		 208 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  64.92 
 
 		 212 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  64.58 
 
 		 208 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  64.58 
 
 		 208 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  64.58 
 
 		 208 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  63.54 
 
 		 208 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  59.41 
 
 		 208 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  59.61 
 
 		 209 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  62.5 
 
 		 208 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  66.01 
 
 		 208 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  62.5 
 
 		 208 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  60.94 
 
 		 209 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  62.5 
 
 		 208 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  62.5 
 
 		 208 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  61.98 
 
 		 208 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  66.15 
 
 		 208 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  61.98 
 
 		 208 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  58.74 
 
 		 210 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  58.42 
 
 		 210 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  63.55 
 
 		 208 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  61.58 
 
 		 211 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  58.25 
 
 		 210 aa  226  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  58.74 
 
 		 210 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  61.86 
 
 		 732 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  59.28 
 
 		 208 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  57.21 
 
 		 224 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  58.91 
 
 		 230 aa  223  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  61.86 
 
 		 208 aa  223  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  56.16 
 
 		 208 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  65.1 
 
 		 208 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  65.1 
 
 		 208 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  63.02 
 
 		 208 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  63.02 
 
 		 208 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  63.02 
 
 		 208 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  61.54 
 
 		 209 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  60.21 
 
 		 209 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  58.91 
 
 		 209 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  58.21 
 
 		 219 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  63.02 
 
 		 208 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  56.25 
 
 		 209 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  64.06 
 
 		 208 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  64.06 
 
 		 208 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  64.06 
 
 		 208 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  59.9 
 
 		 210 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  63.54 
 
 		 208 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  63.54 
 
 		 208 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  63.54 
 
 		 208 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  63.54 
 
 		 208 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  53.96 
 
 		 206 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  59.9 
 
 		 210 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  59.9 
 
 		 210 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  57.77 
 
 		 221 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  58.91 
 
 		 210 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  58.59 
 
 		 209 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  61.03 
 
 		 209 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  59.38 
 
 		 210 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0802  Precorrin-8X methylmutase  59.16 
 
 		 217 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  57.92 
 
 		 209 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  58.82 
 
 		 211 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  57.35 
 
 		 215 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  52.91 
 
 		 220 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  58.25 
 
 		 213 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  56.25 
 
 		 208 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  55.83 
 
 		 221 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  55.45 
 
 		 209 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  55.17 
 
 		 215 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  52.45 
 
 		 209 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  55.96 
 
 		 208 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  56.02 
 
 		 209 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  58.29 
 
 		 209 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2422  precorrin-8X methylmutase  58.42 
 
 		 208 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230932  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  54.69 
 
 		 210 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  48.51 
 
 		 221 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  56.85 
 
 		 209 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  56.85 
 
 		 209 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  56.85 
 
 		 209 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.98 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.87 
 
 		 207 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  44.93 
 
 		 220 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3235  hypothetical protein  36.09 
 
 		 305 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  41.38 
 
 		 209 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  41.38 
 
 		 209 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  41.29 
 
 		 207 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  43.14 
 
 		 210 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42 
 
 		 214 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2455  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  40 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0879303  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  43.62 
 
 		 211 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.51 
 
 		 219 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.5 
 
 		 211 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.73 
 
 		 213 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.79 
 
 		 212 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>