139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2628 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  54.19 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  54.19 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  54.75 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  46.52 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  49.1 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  46.82 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  46.88 
 
 		 259 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  43.69 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 		 259 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  44.14 
 
 		 249 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  46.85 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  46.85 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  46.85 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  46.29 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  43.69 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  42.6 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  42.79 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  47.3 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  43.35 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  44 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  43.75 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  44.34 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  46.19 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  43.24 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  44.93 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  43.3 
 
 		 273 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  44.59 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  45.05 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  44.8 
 
 		 253 aa  161  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  48.39 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  45.05 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  43.69 
 
 		 250 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  45.13 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  45.54 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  43.69 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  42.47 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  44.67 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  44.16 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  44.25 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  47.98 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  44.59 
 
 		 253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  42.99 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  43.24 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  43.24 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  43.24 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  44.39 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  40.66 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  42.08 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  36.61 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  43.56 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  36.49 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  43.46 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  38.5 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  36.61 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  40.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  39.46 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  34.82 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  41.1 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  40 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  44.64 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  37.72 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  35.11 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  43.33 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  42.72 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  36.16 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  37.05 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  32.74 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  38.57 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  32.74 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  37.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  37.33 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  35.59 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  35.56 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  33.77 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  41.44 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  41.44 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  40.54 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  38.29 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  30.74 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  32.07 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  28.75 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  29.91 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  27.39 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07381  precorrin-6X reductase  29.58 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  29.46 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1670  precorrin-6X reductase  29.15 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.85 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  27.66 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  23.93 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  23.5 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0688  precorrin-6A reductase  30.84 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>