More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2609 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  100 
 
 		 157 aa  320  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  69.87 
 
 		 157 aa  226  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  62.24 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  62.94 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  62.24 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  62.24 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  53.15 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  51.41 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  53.62 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  53.62 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  46.85 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  45.89 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  48.25 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  43.62 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  47.22 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  45.38 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  45.38 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  45.65 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  44.12 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  45.22 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  44.44 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  44.06 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  42.22 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  38.52 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.49 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.49 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.53 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  35.77 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  35.77 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  35.51 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.48 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  35.51 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.29 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  34.04 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  34.33 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  34.29 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  34.29 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.56 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  34.06 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.71 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  35.82 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  35.82 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  35.82 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  34.56 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  35.82 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  35.82 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.14 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  33.33 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  33.33 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.48 
 
 		 163 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  28.66 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  32.28 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  34.56 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  30.67 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  31.29 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  33.58 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  32.09 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  32.09 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  32.09 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  32.09 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  32.09 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  31.16 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  31.88 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  32.09 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  34.48 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.07 
 
 		 174 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  32.09 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  35.92 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  33.09 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  31.21 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  31.16 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  35.92 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  35.92 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  31.33 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  35.92 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  35.92 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  31.33 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  35.92 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>