160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2579 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1207    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  48.07 
 
 		 566 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  48.09 
 
 		 624 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  51.18 
 
 		 582 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  45.66 
 
 		 657 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  45.03 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  46.14 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  45.33 
 
 		 637 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  48.45 
 
 		 630 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  34.64 
 
 		 594 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  41.94 
 
 		 632 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 654 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  41.1 
 
 		 492 aa  267  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  40.25 
 
 		 1085 aa  266  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 		 3560 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 		 1094 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 4489 aa  261  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 616 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  33.73 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 3035 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  41.32 
 
 		 700 aa  250  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 569 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  37.99 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 		 732 aa  240  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 740 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 672 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 761 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  34.96 
 
 		 680 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  37.6 
 
 		 452 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 574 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 750 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 750 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 647 aa  206  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 909 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 589 aa  203  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 1106 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.37 
 
 		 816 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 1106 aa  200  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 754 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  34.58 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 660 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.34 
 
 		 570 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 		 295 aa  187  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  30.68 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.77 
 
 		 667 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  34.06 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 739 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 633 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 589 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1714 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 633 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 968 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 739 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 833 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 833 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 789 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 732 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 708 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 828 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  29.1 
 
 		 740 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  30.97 
 
 		 747 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 808 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 828 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 717 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.37 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 828 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.38 
 
 		 1221 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 626 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  32.54 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 789 aa  153  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  29.83 
 
 		 699 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 745 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  29.84 
 
 		 1415 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 719 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.36 
 
 		 797 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.85 
 
 		 739 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 529 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 738 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 734 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 		 790 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 739 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 595 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 727 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  27.38 
 
 		 1596 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.9 
 
 		 708 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.47 
 
 		 937 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 790 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 779 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  29.45 
 
 		 731 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 627 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>