More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2525 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  100 
 
 		 308 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  85.06 
 
 		 308 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  84.74 
 
 		 308 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  82.62 
 
 		 307 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  71.48 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  68.14 
 
 		 307 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  67.54 
 
 		 307 aa  417  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  68.52 
 
 		 305 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  68.52 
 
 		 305 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  65.58 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  59.02 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  58.69 
 
 		 308 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  58.63 
 
 		 308 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  59.09 
 
 		 309 aa  346  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  57.72 
 
 		 307 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  57.14 
 
 		 312 aa  345  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  58.05 
 
 		 307 aa  342  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  56.45 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  59.02 
 
 		 296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  57.24 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  59.34 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.94 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 308 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  57.28 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  56.21 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  56.39 
 
 		 291 aa  318  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  56.58 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  56.63 
 
 		 307 aa  318  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  54.87 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  59.02 
 
 		 291 aa  311  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  56.04 
 
 		 301 aa  309  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  52.49 
 
 		 310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  55.37 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  56.19 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  51.83 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  55.13 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  54.49 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  54.49 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  53.56 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  46.25 
 
 		 303 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  48.39 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.28 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.16 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.72 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.93 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  43.95 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  46.6 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  46.6 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.51 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  49.17 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.39 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.09 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.38 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.52 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  43.51 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.18 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.18 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.17 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.67 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  42.09 
 
 		 314 aa  225  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  46.91 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  44.3 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  43.51 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  43.51 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  39.72 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  41.28 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  45.93 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  44.63 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  43.38 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  41.47 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>