109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2483 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  69.32 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  68.16 
 
 		 204 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  67.05 
 
 		 201 aa  224  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  63.01 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  60.12 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  57.47 
 
 		 184 aa  201  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  62.71 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  51.53 
 
 		 200 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09307  conserved hypothetical protein  45.9 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  65.26 
 
 		 98 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  36.69 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  33.13 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  33.73 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  32.34 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  34.93 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  34.34 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  33.54 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  33.54 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  32.32 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  35.71 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  32.93 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  30.91 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  35.44 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  34.57 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  30.43 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  32.54 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  31.1 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  30.49 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  33.83 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  31.61 
 
 		 262 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  29.07 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  30.49 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  29.41 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  26.95 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  27.38 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  32.52 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  27.11 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  33.11 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  31.1 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  28.99 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  30.34 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  31.82 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  29.88 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  29.88 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  30.83 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  29.52 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  30.92 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  29.5 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  37.37 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  30 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.99 
 
 		 310 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  29.45 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0055  hypothetical protein  27.63 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  34.55 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  32.26 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  25.49 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  29.11 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  29.66 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  28.14 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  26.75 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  26.22 
 
 		 308 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  34.44 
 
 		 218 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  36.49 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  30.63 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  26.58 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  30.63 
 
 		 242 aa  48.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  30.63 
 
 		 242 aa  48.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  32.41 
 
 		 241 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  32.41 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1047  MOSC domain-containing protein  36.67 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3793  MOSC domain containing protein  32.11 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  26.32 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  26.22 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  30.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  26.22 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  37.78 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  34.33 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  26.67 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  24.1 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  31.17 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  26.22 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  30.41 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4172  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4238  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  32.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  30.7 
 
 		 241 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  26.22 
 
 		 234 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  29.82 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7731  hypothetical protein  30.28 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  28.48 
 
 		 239 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  28.85 
 
 		 226 aa  44.3  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>