More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2440 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  78.48 
 
 		 414 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  81.71 
 
 		 413 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  100 
 
 		 416 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  82.72 
 
 		 413 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.64 
 
 		 413 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  82.92 
 
 		 413 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  78 
 
 		 414 aa  675    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  78.48 
 
 		 414 aa  680    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  66.99 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.38 
 
 		 414 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.94 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.82 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  67 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.17 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.54 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.38 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.98 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.3 
 
 		 413 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  63.55 
 
 		 414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.5 
 
 		 420 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  65.93 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.86 
 
 		 418 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.62 
 
 		 418 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.68 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.26 
 
 		 426 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.73 
 
 		 419 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.01 
 
 		 414 aa  534  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  60.59 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  62 
 
 		 407 aa  511  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.82 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  61.33 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.08 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  58.87 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.52 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.43 
 
 		 408 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.86 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  54.57 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.15 
 
 		 413 aa  454  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.79 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.24 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  52.33 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.64 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.64 
 
 		 629 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  52 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.11 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  52 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  51.33 
 
 		 423 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  50.24 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  51 
 
 		 626 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.61 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.83 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.11 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.6 
 
 		 657 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.98 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.15 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.28 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.89 
 
 		 774 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.23 
 
 		 421 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.39 
 
 		 678 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.14 
 
 		 662 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.99 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.49 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  48.91 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.95 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 		 404 aa  418  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  50.74 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  50.88 
 
 		 682 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  51.13 
 
 		 688 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  50.12 
 
 		 665 aa  418  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.39 
 
 		 650 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  51.52 
 
 		 661 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.38 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  49.26 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.87 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  50.88 
 
 		 666 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  46.93 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.13 
 
 		 666 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.76 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.26 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.63 
 
 		 605 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  49.88 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.51 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.97 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.89 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.88 
 
 		 641 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  48.64 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  48.64 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.64 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  49.87 
 
 		 604 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 664 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.13 
 
 		 630 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  49.87 
 
 		 604 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  46.9 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>