More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2436 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  91.24 
 
 		 262 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  91.24 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  88.84 
 
 		 251 aa  457  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  84.06 
 
 		 251 aa  434  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  84.06 
 
 		 251 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  84.06 
 
 		 280 aa  434  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  78.88 
 
 		 251 aa  417  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  78.49 
 
 		 251 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  71.31 
 
 		 249 aa  363  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  71.02 
 
 		 250 aa  358  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  67.73 
 
 		 252 aa  357  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  70.2 
 
 		 250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  70.2 
 
 		 250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  69.8 
 
 		 250 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  68.53 
 
 		 250 aa  353  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  65.06 
 
 		 251 aa  352  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  69.8 
 
 		 250 aa  352  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 252 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  66.26 
 
 		 249 aa  352  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  66.14 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  67.48 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  66.26 
 
 		 249 aa  348  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  66.39 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  66.93 
 
 		 253 aa  345  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  64.54 
 
 		 251 aa  344  8e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  64.54 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  63.97 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  65.86 
 
 		 251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  68.88 
 
 		 249 aa  337  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1607  FeS assembly ATPase SufC  68.53 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00745955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  66.14 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  60.96 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  64.4 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  64.37 
 
 		 252 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  64.4 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  64.61 
 
 		 246 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  65.02 
 
 		 248 aa  325  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  63.56 
 
 		 252 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  65.02 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  63.82 
 
 		 247 aa  318  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  61.85 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  61.6 
 
 		 250 aa  315  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  61.42 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  62.15 
 
 		 254 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  61.29 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  60.96 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  63.01 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.96 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  58.57 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  59.26 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  60.4 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  62.23 
 
 		 243 aa  304  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 		 247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  61.73 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  61.32 
 
 		 280 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  56.8 
 
 		 250 aa  301  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  60.66 
 
 		 280 aa  301  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  58.5 
 
 		 257 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  57.38 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  59.84 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  59.84 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  58.96 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 		 254 aa  298  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 		 260 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  62.14 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  62.14 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  59.84 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  59.43 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  61.73 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  59.84 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  59.43 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  59.84 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  59.43 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  59.43 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  59.43 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  58.54 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  59.02 
 
 		 248 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  59.02 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  58.85 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  57.83 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  57.25 
 
 		 264 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  58.2 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  58.2 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  58.2 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  58.2 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  58.2 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  58.2 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>