More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2432 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6178  lysine exporter protein LysE/YggA  49.24 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.04 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  32.81 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.91 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.6 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  29.72 
 
 		 217 aa  89  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.7 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.5 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  31 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  31 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.76 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.76 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.03 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  30.16 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.03 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.93 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  36.03 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2171  amino acid transporter LysE  34.15 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33.33 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  36.43 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.64 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3569  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  28.78 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.29 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.33 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.15 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.81 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  31.53 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  30.41 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.55 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  29.02 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  29.02 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.55 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.4 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  28.5 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  25.84 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.53 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.33 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.05 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>