165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2410 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1283    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  65.21 
 
 		 582 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  42.88 
 
 		 657 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  42.9 
 
 		 657 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  48.09 
 
 		 588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  49.31 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  47.66 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  42.73 
 
 		 633 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  43.62 
 
 		 630 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  34.92 
 
 		 632 aa  280  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1085 aa  266  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 4489 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.95 
 
 		 654 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 700 aa  257  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 3560 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 1094 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  34.68 
 
 		 492 aa  249  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 		 740 aa  241  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 574 aa  239  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 3035 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 616 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  34.37 
 
 		 594 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 750 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 761 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  34.79 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 732 aa  227  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 611 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 560 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 569 aa  223  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  36.41 
 
 		 459 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 667 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 632 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 647 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 750 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.39 
 
 		 816 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.34 
 
 		 1106 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.58 
 
 		 589 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.75 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 909 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  31.44 
 
 		 568 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 590 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.26 
 
 		 589 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 789 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  33.61 
 
 		 590 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 1106 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 754 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 754 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  30.26 
 
 		 680 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 295 aa  184  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 660 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 739 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 739 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 706 aa  174  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 833 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 		 833 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 626 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 828 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.34 
 
 		 529 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 808 aa  170  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 1714 aa  170  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  31.52 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  29.42 
 
 		 619 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.81 
 
 		 719 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 739 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 738 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 633 aa  164  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  30.32 
 
 		 747 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.11 
 
 		 739 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 828 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 828 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.56 
 
 		 745 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.97 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 968 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  30.58 
 
 		 596 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 		 667 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.79 
 
 		 699 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  32.59 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.61 
 
 		 797 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 718 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 717 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 824 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 727 aa  154  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  28.76 
 
 		 740 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 717 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.96 
 
 		 937 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 779 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.33 
 
 		 708 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 627 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 647 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.97 
 
 		 780 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 780 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 		 781 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 776 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>