More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2388 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  66.79 
 
 		 826 aa  1071    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1129  heavy metal translocating P-type ATPase  52.76 
 
 		 840 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.979362 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  42.53 
 
 		 828 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.53 
 
 		 802 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  45.79 
 
 		 803 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  47.25 
 
 		 835 aa  674    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  44.16 
 
 		 806 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.84 
 
 		 805 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  61.72 
 
 		 826 aa  1006    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  43.61 
 
 		 828 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  48.17 
 
 		 811 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.72 
 
 		 805 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  43.72 
 
 		 805 aa  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.72 
 
 		 805 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  62.2 
 
 		 762 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  46.1 
 
 		 782 aa  656    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  62.17 
 
 		 835 aa  991    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  46.93 
 
 		 836 aa  712    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  53.94 
 
 		 813 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.72 
 
 		 806 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  54.86 
 
 		 830 aa  780    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  62.18 
 
 		 839 aa  997    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  56.13 
 
 		 834 aa  853    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.75 
 
 		 753 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  47.03 
 
 		 750 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.03 
 
 		 806 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  62.2 
 
 		 762 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2890  copper-translocating P-type ATPase  54.17 
 
 		 813 aa  766    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  59.14 
 
 		 834 aa  941    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 752 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  54.85 
 
 		 825 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  44.97 
 
 		 818 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 		 821 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.72 
 
 		 805 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  62.56 
 
 		 829 aa  933    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  45.89 
 
 		 759 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.22 
 
 		 815 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  63.13 
 
 		 852 aa  1011    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  61.51 
 
 		 833 aa  966    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  42.45 
 
 		 894 aa  656    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  59.17 
 
 		 744 aa  801    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  66.38 
 
 		 827 aa  1073    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  62.06 
 
 		 762 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  46.54 
 
 		 849 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 797 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  63.66 
 
 		 829 aa  971    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  48.75 
 
 		 831 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  56.93 
 
 		 838 aa  851    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  54.93 
 
 		 837 aa  868    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  58.43 
 
 		 836 aa  911    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  62.33 
 
 		 841 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  54.32 
 
 		 856 aa  808    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  48.17 
 
 		 811 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  46.43 
 
 		 837 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  55.2 
 
 		 832 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  45.93 
 
 		 839 aa  676    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  61.47 
 
 		 827 aa  1007    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  58.43 
 
 		 836 aa  911    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  55.42 
 
 		 838 aa  869    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  55.61 
 
 		 836 aa  889    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  54.69 
 
 		 833 aa  825    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  54.52 
 
 		 814 aa  820    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  43.84 
 
 		 805 aa  660    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.99 
 
 		 837 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  44.79 
 
 		 797 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  50.46 
 
 		 751 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 		 750 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  49.78 
 
 		 846 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  63.16 
 
 		 855 aa  996    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  61.31 
 
 		 833 aa  981    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  41.73 
 
 		 889 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 889 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  53.4 
 
 		 826 aa  829    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.47 
 
 		 817 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  58.9 
 
 		 827 aa  916    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  51.3 
 
 		 821 aa  777    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  48.95 
 
 		 837 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  45.89 
 
 		 759 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  62.35 
 
 		 841 aa  989    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  43.84 
 
 		 805 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.89 
 
 		 885 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  62.35 
 
 		 759 aa  934    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  62.2 
 
 		 762 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.84 
 
 		 814 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  47.02 
 
 		 778 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  62.06 
 
 		 767 aa  921    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  100 
 
 		 819 aa  1630    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 786 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.53 
 
 		 802 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  54.69 
 
 		 807 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  50.07 
 
 		 754 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  55.09 
 
 		 824 aa  779    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  61.34 
 
 		 841 aa  961    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41.45 
 
 		 844 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  55.29 
 
 		 857 aa  872    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  54.59 
 
 		 832 aa  776    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  64.7 
 
 		 840 aa  1027    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  47.11 
 
 		 747 aa  633  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  45.32 
 
 		 742 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 		 866 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>