231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2369 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  71.75 
 
 		 223 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  69.06 
 
 		 223 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  58.8 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  51.18 
 
 		 224 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  50.24 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  50.24 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  44.34 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  44.55 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  42.73 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  47.49 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  43.4 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  41.98 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  44.28 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  48.02 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  41.12 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  43.87 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  45.54 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  43.13 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  39.82 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  39.25 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  40.47 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  40.47 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  39.72 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  38.68 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  37.79 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  41.26 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  36.65 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  37.98 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  42.33 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  38.83 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  38.83 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  36.79 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40.98 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  39.52 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  138  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  35.62 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.72 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  37.32 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.71 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  34.88 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  36.53 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  32.71 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  35.19 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.72 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  35.19 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  35.78 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  31.65 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>