More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2271 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  84.17 
 
 		 278 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  84.31 
 
 		 274 aa  497  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  84.17 
 
 		 278 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  83.52 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  81.92 
 
 		 275 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  81.18 
 
 		 275 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  81.18 
 
 		 299 aa  467  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  72.01 
 
 		 276 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  69.71 
 
 		 277 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  69.26 
 
 		 275 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  67.15 
 
 		 274 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  66.79 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 274 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  67.04 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  65.93 
 
 		 271 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  64.98 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  64.36 
 
 		 274 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  63.7 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  65.88 
 
 		 274 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  63.28 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  62.68 
 
 		 279 aa  358  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 		 283 aa  355  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  64.68 
 
 		 279 aa  355  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  61.54 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  63.18 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  62.55 
 
 		 284 aa  348  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  59.78 
 
 		 274 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  62.55 
 
 		 284 aa  348  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  63.04 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  63.04 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  62.5 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 275 aa  344  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  61.57 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  61.57 
 
 		 271 aa  335  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  61.02 
 
 		 271 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  60.71 
 
 		 263 aa  332  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  57.46 
 
 		 276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  58.7 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  56.05 
 
 		 260 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  56.05 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  56.05 
 
 		 260 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  56.05 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  53.23 
 
 		 260 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  54.98 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  54.98 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  54.84 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  54.36 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  55.37 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  55.24 
 
 		 260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  52.42 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  53.33 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  53.57 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  53.52 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  54.4 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  54.77 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 		 275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  52.82 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  52.83 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  52.47 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  55.25 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  51.88 
 
 		 255 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 		 269 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 		 269 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  52.73 
 
 		 266 aa  278  8e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 261 aa  278  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  52.42 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 		 262 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  51.69 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  52.43 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  51.56 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  51.69 
 
 		 271 aa  275  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  51.69 
 
 		 271 aa  275  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  50.57 
 
 		 267 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  50.19 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  53.36 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  54.84 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  51.04 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  52.44 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  51.04 
 
 		 254 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  51.31 
 
 		 276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.95 
 
 		 270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  50.97 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  49.81 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  53.6 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  52.33 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>