More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2215 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  100 
 
 
323 aa  654  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  87.93 
 
 
323 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  87.62 
 
 
323 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  85.45 
 
 
323 aa  564  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  80.56 
 
 
324 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  82.89 
 
 
323 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  81.91 
 
 
323 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  75.8 
 
 
327 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  75.8 
 
 
327 aa  501  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  73.44 
 
 
345 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  75.57 
 
 
307 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  73.89 
 
 
343 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  74.68 
 
 
347 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.87 
 
 
357 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.18 
 
 
357 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.7 
 
 
333 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.5 
 
 
338 aa  459  1e-128  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.55 
 
 
347 aa  458  1e-128  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.94 
 
 
328 aa  461  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.55 
 
 
333 aa  440  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  67.2 
 
 
375 aa  434  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  65.79 
 
 
358 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  63.38 
 
 
343 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.1 
 
 
326 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  63.46 
 
 
359 aa  406  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  64.74 
 
 
370 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  63.95 
 
 
370 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  64.1 
 
 
370 aa  399  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  61.95 
 
 
365 aa  400  1e-110  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  63.14 
 
 
370 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  62.5 
 
 
369 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  54.86 
 
 
351 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  54.04 
 
 
350 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  51.75 
 
 
343 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  52.05 
 
 
343 aa  339  3e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.28 
 
 
347 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.58 
 
 
303 aa  254  1e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.93 
 
 
301 aa  252  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  45.39 
 
 
304 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  45.73 
 
 
304 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
304 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  46.42 
 
 
304 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.76339e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
304 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.25089e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  42.9 
 
 
325 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
325 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  45.21 
 
 
305 aa  246  5e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  46.18 
 
 
334 aa  244  2e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  40.97 
 
 
323 aa  244  2e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  46.18 
 
 
334 aa  244  2e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.5 
 
 
334 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  43 
 
 
298 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.77 
 
 
302 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.42 
 
 
332 aa  242  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
324 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
334 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  43.58 
 
 
328 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  43.37 
 
 
322 aa  239  6e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  42.86 
 
 
304 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  42.02 
 
 
307 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.59 
 
 
334 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.71 
 
 
306 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.61 
 
 
344 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  41.16 
 
 
304 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  46.6 
 
 
302 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.08 
 
 
324 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  46.94 
 
 
302 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  43.54 
 
 
303 aa  236  5e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.19 
 
 
317 aa  236  5e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  47.44 
 
 
302 aa  236  5e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.28992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.05 
 
 
330 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.42 
 
 
295 aa  235  9e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  42.91 
 
 
328 aa  234  1e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  41 
 
 
304 aa  234  1e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  41.5 
 
 
319 aa  234  1e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  41.2 
 
 
333 aa  234  2e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.72 
 
 
338 aa  234  2e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.16 
 
 
323 aa  233  4e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  42.67 
 
 
310 aa  232  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  40.67 
 
 
304 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 
322 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  43 
 
 
348 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  40 
 
 
318 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  45.28 
 
 
331 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  42.11 
 
 
320 aa  230  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  40.33 
 
 
304 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  41.03 
 
 
329 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  46.28 
 
 
326 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.12 
 
 
303 aa  229  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
323 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  43.54 
 
 
304 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  43.2 
 
 
321 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.33 
 
 
304 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.06 
 
 
304 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.98 
 
 
349 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  40.33 
 
 
304 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  43.05 
 
 
320 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.61 
 
 
307 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.41 
 
 
346 aa  226  5e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.39 
 
 
298 aa  226  5e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  40.92 
 
 
323 aa  225  8e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>