More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2080 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  65.95 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  66.22 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  64.22 
 
 		 227 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  55 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  51.33 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  52.53 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  52.07 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  53.88 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  50.66 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.3 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  52.13 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  45.67 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  47.44 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  48.33 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  46.98 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  47.85 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  47.62 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  45.62 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  45.62 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  45.24 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  46.48 
 
 		 461 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  48.08 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  35.09 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 223 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  41.45 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  39.52 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  39.47 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  35.16 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  39.01 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  39.04 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  39.73 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.95 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  35.11 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  35.11 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.11 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  37.37 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  33.96 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  37.57 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>