More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2044 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  58.42 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  55.82 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  55.41 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  54.67 
 
 		 319 aa  291  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  53.29 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  52.79 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.72 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  47.87 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.67 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.49 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  47.04 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  45.52 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  42.71 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.06 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  41.64 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  41.58 
 
 		 290 aa  178  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  37.5 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  35.29 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.14 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.63 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.48 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  35.34 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  38.49 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  33.67 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  33.46 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.74 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  35.69 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  37.09 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  34.86 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  31.99 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.74 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.67 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  29.29 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.68 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  33.1 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  33.92 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  35.79 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  32.08 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  33.33 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  32.55 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  33.33 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.13 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.13 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  34.73 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.33 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  32.42 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  29.5 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  31.1 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  32.65 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  33.01 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  33.01 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  33.01 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.57 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.08 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  32.4 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  31.44 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  37 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  37 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  31.8 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  31.8 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  32.03 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  34.15 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  31.83 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  33.21 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  35.53 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30.98 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  30.21 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  29.24 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  30.99 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.95 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  30.2 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.3 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  33.83 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.47 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.8 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  34.19 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  26.07 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>