More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1941 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.92 
 
 		 736 aa  934    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 745 aa  1524    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.43 
 
 		 733 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.9 
 
 		 749 aa  959    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.95 
 
 		 744 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.3 
 
 		 759 aa  759    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.49 
 
 		 733 aa  681    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  86.71 
 
 		 744 aa  1327    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  82.77 
 
 		 740 aa  1236    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  86.66 
 
 		 743 aa  1326    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.73 
 
 		 737 aa  856    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.17 
 
 		 741 aa  938    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  82.77 
 
 		 740 aa  1236    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.14 
 
 		 733 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  79.57 
 
 		 743 aa  1146    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.02 
 
 		 740 aa  929    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1308  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.86 
 
 		 737 aa  912    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.64 
 
 		 777 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.6 
 
 		 746 aa  926    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.8 
 
 		 723 aa  893    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69.96 
 
 		 739 aa  1047    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.96 
 
 		 737 aa  658    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.41 
 
 		 740 aa  892    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.05 
 
 		 759 aa  753    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.71 
 
 		 742 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.53 
 
 		 736 aa  925    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.7 
 
 		 719 aa  856    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.85 
 
 		 767 aa  763    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 739 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.16 
 
 		 719 aa  880    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.21 
 
 		 736 aa  936    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.29 
 
 		 739 aa  658    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.41 
 
 		 737 aa  805    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.84 
 
 		 736 aa  940    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.48 
 
 		 744 aa  925    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.13 
 
 		 768 aa  670    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.16 
 
 		 721 aa  872    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.82 
 
 		 747 aa  846    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.48 
 
 		 764 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  77.09 
 
 		 744 aa  1133    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.7 
 
 		 727 aa  842    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50 
 
 		 739 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.17 
 
 		 737 aa  977    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.62 
 
 		 735 aa  958    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.21 
 
 		 735 aa  976    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.37 
 
 		 741 aa  845    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.98 
 
 		 741 aa  964    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.43 
 
 		 724 aa  895    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.3 
 
 		 736 aa  918    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.29 
 
 		 739 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.89 
 
 		 719 aa  925    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.44 
 
 		 759 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.78 
 
 		 761 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.71 
 
 		 723 aa  905    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.12 
 
 		 737 aa  977    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  82.63 
 
 		 740 aa  1231    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.58 
 
 		 741 aa  961    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.15 
 
 		 739 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.99 
 
 		 742 aa  673    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  72.07 
 
 		 737 aa  1103    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.14 
 
 		 741 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.12 
 
 		 741 aa  966    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.66 
 
 		 733 aa  633  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.72 
 
 		 767 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.55 
 
 		 761 aa  626  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.15 
 
 		 754 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.56 
 
 		 760 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.1 
 
 		 775 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.02 
 
 		 761 aa  621  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.58 
 
 		 761 aa  621  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.19 
 
 		 777 aa  621  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.21 
 
 		 767 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.07 
 
 		 758 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.41 
 
 		 751 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.84 
 
 		 760 aa  618  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.66 
 
 		 750 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.69 
 
 		 758 aa  613  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.89 
 
 		 770 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.09 
 
 		 739 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.18 
 
 		 765 aa  615  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.33 
 
 		 803 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.34 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.53 
 
 		 802 aa  609  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.78 
 
 		 782 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.77 
 
 		 803 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.76 
 
 		 729 aa  605  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.99 
 
 		 779 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.75 
 
 		 729 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.75 
 
 		 729 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.44 
 
 		 725 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.25 
 
 		 779 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.09 
 
 		 754 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.44 
 
 		 779 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.64 
 
 		 746 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>