More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1934 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  70.85 
 
 		 274 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  63.6 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  62.59 
 
 		 274 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  59.56 
 
 		 274 aa  357  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  53.61 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  52.38 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  48.72 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  52.38 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  48.35 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  48.47 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  44.61 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  44.78 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  43.01 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  42.8 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  39.61 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  35.4 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  41.22 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  40.15 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  38.26 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  37.88 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  36.98 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  35.85 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  34.96 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  29.96 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  31.98 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  31.98 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1838  inositol monophosphatase  32.92 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0673  Inositol-phosphate phosphatase  33.06 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  31.05 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0197  inositol monophosphatase  32.03 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  32.92 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  30.68 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  31.05 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1992  inositol-1-monophosphatase  33.78 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  31.4 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  28.98 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  29.29 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000102923  hitchhiker  0.0000000006834 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6576  Inositol-phosphate phosphatase  32.63 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516449  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  28.94 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  30.2 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  32.26 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  31.36 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  30 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  30.58 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6169  Inositol-phosphate phosphatase  32.75 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1820  inositol monophosphatase  29.81 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  32.04 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29004  predicted protein  32.02 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  29.67 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  30 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  27.47 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.15 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  31.1 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  28.24 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  27.84 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.4 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  32.02 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1407  inositol monophosphatase  30.22 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  29.68 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  30.22 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  28.63 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  31.16 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  28.79 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.4 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  29.68 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  28.23 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  31.09 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  28.74 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4997  Inositol-phosphate phosphatase  29.83 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000132366  normal  0.733856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  31.22 
 
 		 260 aa  89.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  30.23 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000252692  hitchhiker  0.000000465281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  31.78 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  28.14 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  27.94 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  28.23 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  28.87 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  30.86 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  28.87 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  29.15 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  31.07 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  29.22 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  30.3 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  29.95 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  27.31 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  32.59 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  31.14 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2748  histidinol-phosphate phosphatase, putative  28.51 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0337561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  32.38 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  29.39 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5608  extragenic suppressor protein SuhB  31.91 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  30.65 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  30.48 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.34 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  32.06 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.05 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  28.92 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6008  inositol monophosphatase  30.74 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  31.13 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>