23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1678 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00270694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1676  hypothetical protein  67.97 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.746938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4232  hypothetical protein  42.03 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332018  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1185  hypothetical protein  40.23 
 
 		 658 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0534773  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1274  hypothetical protein  40.23 
 
 		 658 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.367202 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1421  hypothetical protein  42 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2530  hypothetical protein  41.9 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1319  hypothetical protein  41.6 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1839  hypothetical protein  34.67 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1656  hypothetical protein  37.07 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  34.48 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1667  hypothetical protein  31.27 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2307  hypothetical protein  34.13 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3067  hypothetical protein  32.14 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2055  hypothetical protein  32.85 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2059  hypothetical protein  32.85 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.302728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2301  hypothetical protein  32.85 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00584965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2275  hypothetical protein  32.85 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.969243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2121  hypothetical protein  32.85 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.9714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2385  hypothetical protein  33.06 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2258  hypothetical protein  32.14 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 866 aa  55.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>