48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1673 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  44.14 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  38.04 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  38.04 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  38.04 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  38.04 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  38.04 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  37.75 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0003  streptomycin resistance protein, StrB  37.29 
 
 		 200 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  38.5 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  37.98 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.72 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.33 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.7 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  32.85 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.55 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.68 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  33.46 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.11 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  35.56 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.19 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  36.45 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  36.45 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  36.45 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  30.77 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.62 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.07 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.27 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.38 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.47 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.56 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  41.35 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.98 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  40.43 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.69 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  38.21 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.3 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  37.78 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.45 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.9 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  25.97 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  35.54 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  23.22 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2660  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.56 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  32.74 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  32.2 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>