More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1644 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  68.95 
 
 		 225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.67 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.01 
 
 		 224 aa  277  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  64.38 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  63.01 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  58.88 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  55.71 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  55.71 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  55.71 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  58.25 
 
 		 691 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  55.71 
 
 		 242 aa  237  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  55.25 
 
 		 232 aa  237  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  55.25 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  56.94 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.13 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  54.13 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.13 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  53.88 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.42 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.42 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.5 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  53.33 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  54.31 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  51.87 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  51.17 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  53.49 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  53.49 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  56.42 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.51 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  44.78 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  44.78 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  53.5 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.24 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  51.46 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  51.46 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  49.54 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.77 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  49.77 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  51.31 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  47.14 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  46.73 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  43.78 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  47.5 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.34 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  45.05 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.58 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  47.24 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  43.63 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.24 
 
 		 276 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  42.13 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.65 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  51.27 
 
 		 261 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  43 
 
 		 243 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.26 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  41.06 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.07 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  43.39 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.39 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.39 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.41 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.84 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.2 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  45.6 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.3 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  56.62 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 		 246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 		 234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  39.17 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  40.89 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.4 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  37.31 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  37.63 
 
 		 241 aa  134  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  37.63 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.86 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  37.31 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.59 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  40.87 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.42 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  40.93 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  39.18 
 
 		 326 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.71 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.93 
 
 		 284 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  37.93 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.93 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  35.57 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  46.36 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  37.19 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.2 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.34 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>