298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1580 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  62.55 
 
 		 790 aa  916    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  88.75 
 
 		 734 aa  1326    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  58.63 
 
 		 742 aa  837    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  63.41 
 
 		 749 aa  934    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  58.71 
 
 		 721 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  75.78 
 
 		 746 aa  1115    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  66.34 
 
 		 726 aa  976    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  65.4 
 
 		 736 aa  954    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  58.94 
 
 		 764 aa  828    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  62.66 
 
 		 788 aa  915    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  75.64 
 
 		 746 aa  1112    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  100 
 
 		 753 aa  1548    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  65.04 
 
 		 733 aa  943    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  65.01 
 
 		 750 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  61.58 
 
 		 788 aa  923    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  55.12 
 
 		 728 aa  767    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  66.71 
 
 		 731 aa  957    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  65.37 
 
 		 735 aa  927    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  59.37 
 
 		 754 aa  833    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  74.82 
 
 		 764 aa  1104    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  65.4 
 
 		 733 aa  951    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  54.92 
 
 		 724 aa  771    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  64.97 
 
 		 736 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  57.33 
 
 		 727 aa  793    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  65.76 
 
 		 759 aa  946    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  61.58 
 
 		 788 aa  923    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  65.62 
 
 		 741 aa  945    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  60.14 
 
 		 736 aa  878    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  56.18 
 
 		 724 aa  776    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  56.89 
 
 		 722 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  64.86 
 
 		 813 aa  942    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  75.14 
 
 		 754 aa  1107    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  87.48 
 
 		 736 aa  1293    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  89.03 
 
 		 734 aa  1327    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  58.12 
 
 		 724 aa  860    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  65.36 
 
 		 801 aa  950    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  54.81 
 
 		 721 aa  734    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  55.12 
 
 		 728 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  54.48 
 
 		 729 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  44.38 
 
 		 731 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  45.73 
 
 		 720 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  45.48 
 
 		 721 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  45.61 
 
 		 713 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  44.71 
 
 		 736 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  46.37 
 
 		 707 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  46.55 
 
 		 765 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  47.15 
 
 		 707 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  45.13 
 
 		 702 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  46.59 
 
 		 709 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  48.12 
 
 		 749 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  45.56 
 
 		 722 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  44.8 
 
 		 708 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  45.56 
 
 		 722 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  44.54 
 
 		 695 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  45.22 
 
 		 700 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  44.68 
 
 		 745 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  44.92 
 
 		 721 aa  576  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  46.27 
 
 		 721 aa  578  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  45.8 
 
 		 744 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  45.19 
 
 		 713 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  45.74 
 
 		 691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  44.36 
 
 		 696 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  43.58 
 
 		 731 aa  569  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  45.57 
 
 		 700 aa  571  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  45.69 
 
 		 729 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  46.43 
 
 		 731 aa  568  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  46.29 
 
 		 766 aa  567  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  45.98 
 
 		 745 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  44.24 
 
 		 709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  44.91 
 
 		 708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  45.29 
 
 		 762 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  44.99 
 
 		 702 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  43.51 
 
 		 709 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  45.93 
 
 		 728 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  46.56 
 
 		 749 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  44.11 
 
 		 701 aa  556  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  46.19 
 
 		 727 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  43.52 
 
 		 743 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  46.25 
 
 		 687 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  43.07 
 
 		 709 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.08 
 
 		 708 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  45.82 
 
 		 697 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  42.14 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  42.5 
 
 		 694 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  45.39 
 
 		 712 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  47.14 
 
 		 705 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  43.99 
 
 		 882 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.39 
 
 		 714 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  46.29 
 
 		 730 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  43.55 
 
 		 743 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  43.26 
 
 		 712 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  45.47 
 
 		 703 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  41.91 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  45.84 
 
 		 742 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  45.84 
 
 		 742 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  45.84 
 
 		 742 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  45.12 
 
 		 741 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  43.17 
 
 		 770 aa  545  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  42.88 
 
 		 720 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  42.9 
 
 		 715 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>