More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1411 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  64.78 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  63.76 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  64.09 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  56.94 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  55.78 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  51.53 
 
 		 347 aa  325  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  52.65 
 
 		 336 aa  321  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  51.6 
 
 		 398 aa  304  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  48.99 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  50.53 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.53 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  48.31 
 
 		 320 aa  271  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  45.28 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  46.76 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  46.45 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  46.57 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 		 320 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  45.08 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  45.32 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  44.96 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  44.06 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  44.6 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  44.13 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  43.58 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  43.77 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  43.43 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  43.26 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  48.23 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  47.16 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  42.2 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  45.42 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  44.11 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 		 335 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  44.37 
 
 		 329 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 		 568 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.15 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  39.72 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  38.75 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  40.49 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 		 343 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  36.55 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  40.96 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  37.91 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 323 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  34.15 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  37.89 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  31.93 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.5 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  41.15 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  39.15 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 243 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 234 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.68 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.77 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.03 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.64 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.45 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.15 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.15 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.15 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.15 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.46 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.8 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>