More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1373 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  48.49 
 
 		 783 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.97 
 
 		 784 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.73 
 
 		 772 aa  974    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.28 
 
 		 769 aa  1025    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.63 
 
 		 769 aa  1017    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 		 774 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  100 
 
 		 790 aa  1613    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  48.49 
 
 		 783 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 770 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  43.75 
 
 		 771 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  43.62 
 
 		 774 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 779 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 769 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  43.94 
 
 		 771 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  44.13 
 
 		 786 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 786 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 797 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  41.38 
 
 		 773 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 775 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 		 786 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 		 775 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 782 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 764 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 795 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 793 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 		 600 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 911 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 844 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 661 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  33.96 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 773 aa  244  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 523 aa  239  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 778 aa  231  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 		 798 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 617 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1169 aa  220  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 513 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1135 aa  218  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 856 aa  217  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 		 1501 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  48.26 
 
 		 503 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  45.67 
 
 		 513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 927 aa  213  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 513 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  45.96 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 484 aa  212  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  45.96 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 512 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  46.98 
 
 		 508 aa  210  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  41.53 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 511 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 579 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 531 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  44.78 
 
 		 288 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 505 aa  204  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 620 aa  204  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 511 aa  204  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 969 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 717 aa  203  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 389 aa  202  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  44.09 
 
 		 532 aa  202  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  45.37 
 
 		 525 aa  201  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.66 
 
 		 687 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 1000 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1274 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 1138 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 		 468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 377 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  39.31 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 989 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  42.16 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 763 aa  197  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 511 aa  197  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1276 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 1109 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  40.37 
 
 		 1410 aa  196  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1296 aa  195  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 582 aa  195  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 989 aa  195  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 643 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 456 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 536 aa  194  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 518 aa  194  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 533 aa  194  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 605 aa  193  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 917 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 594 aa  193  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 587 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 646 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 1352 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 646 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 509 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.41 
 
 		 470 aa  191  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 536 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>