18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1287 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  246  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  42.59 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  44.57 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  38.32 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  41.27 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  43.55 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  53.7 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  51.61 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  48.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 501 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000175242  decreased coverage  0.000074483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  40.3 
 
 		 426 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.94 
 
 		 520 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000222997  hitchhiker  0.00000014852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.1 
 
 		 453 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 500 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  34.62 
 
 		 455 aa  40.4  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.54 
 
 		 506 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>