More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1274 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  100 
 
 
168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  71.86 
 
 
169 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0996  GCN5-related N-acetyltransferase  70.06 
 
 
183 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0583  GCN5-related N-acetyltransferase  61.35 
 
 
177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  63.8 
 
 
166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  61.35 
 
 
185 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  63.75 
 
 
172 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  62.96 
 
 
169 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4892  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  61.64 
 
 
180 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  59.38 
 
 
171 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5068  putative GNAT family acetyltransferase  64.05 
 
 
164 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  59.26 
 
 
171 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0702354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
171 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449893  hitchhiker  0.00644876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4846  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
171 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  60.25 
 
 
172 aa  200  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  61.49 
 
 
175 aa  200  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1629  acetyltransferase  59.38 
 
 
193 aa  200  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  58.75 
 
 
172 aa  200  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  60.25 
 
 
172 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2054  acetyltransferase, GNAT family  59.38 
 
 
193 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000047072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  59.01 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1718  acetyltransferase, GNAT family  59.38 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01405  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  59.38 
 
 
172 aa  198  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
172 aa  198  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01416  hypothetical protein  59.38 
 
 
172 aa  198  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1534  acetyltransferase  59.38 
 
 
193 aa  198  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  59.01 
 
 
171 aa  198  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  59.38 
 
 
172 aa  198  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  58.39 
 
 
164 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1751  phosphinothricin acetyltransferase  58.39 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1708  phosphinothricin acetyltransferase  58.39 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0205864  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1570  phosphinothricin acetyltransferase  58.39 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.538734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1705  phosphinothricin acetyltransferase  58.39 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.667334  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1770  phosphinothricin acetyltransferase  58.39 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  56.52 
 
 
164 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  60.84 
 
 
178 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  61.49 
 
 
175 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  56.88 
 
 
165 aa  177  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  53.16 
 
 
171 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  53.16 
 
 
171 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2857  acetyltransferase, GNAT family  43.21 
 
 
170 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000726351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2817  acetyltransferase, GNAT family  43.21 
 
 
170 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000095145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  44.03 
 
 
170 aa  153  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2568  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.98 
 
 
170 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
165 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2475  acetyltransferase, GNAT family  42.77 
 
 
170 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357932  normal  0.684775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  44.1 
 
 
167 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  47.77 
 
 
173 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2837  acetyltransferase  42.14 
 
 
170 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000369165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3983  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2611  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2535  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.88 
 
 
170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0379071  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  48.43 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  44.91 
 
 
200 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  44.05 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4837  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2159  GCN5-related N-acetyltransferase  46.25 
 
 
184 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147439  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
186 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4258  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
182 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257172  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 
182 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 
182 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
187 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3133  putative antibiotic resistance (acetyltransferase) protein  45 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
247 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
247 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
247 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
181 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0487  N-acetyltransferase  43.64 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
247 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
247 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
188 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.58 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04066  N-acetyltransferase  42.07 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.691269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  43.29 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293431  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  42.51 
 
 
170 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
205 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  43.83 
 
 
176 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.28 
 
 
188 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
185 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  38.61 
 
 
164 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  46.91 
 
 
176 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1028  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
182 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.517814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  42.69 
 
 
168 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
183 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  45.06 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  40.37 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0784  GNAT family acetyltransferase  37.65 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>