More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1245 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  84.92 
 
 		 199 aa  359  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  84.42 
 
 		 199 aa  357  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  84.85 
 
 		 198 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  82.5 
 
 		 200 aa  349  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  82.5 
 
 		 200 aa  347  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  82 
 
 		 200 aa  346  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  78.39 
 
 		 199 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  78.46 
 
 		 198 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  77.27 
 
 		 198 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  75.88 
 
 		 199 aa  324  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  75.38 
 
 		 199 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  73.87 
 
 		 199 aa  318  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  77.04 
 
 		 199 aa  317  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  72.86 
 
 		 199 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  72.36 
 
 		 198 aa  308  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  72.73 
 
 		 198 aa  307  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  71.86 
 
 		 199 aa  307  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  71.57 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  76.26 
 
 		 200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  68.69 
 
 		 199 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  71.21 
 
 		 199 aa  299  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  71.21 
 
 		 199 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  71.21 
 
 		 199 aa  299  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  69 
 
 		 199 aa  299  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  53 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  52.6 
 
 		 229 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 199 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  55.05 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  52 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  52 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  56.12 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  53.06 
 
 		 209 aa  214  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  54.77 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  50.5 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  51.74 
 
 		 201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 198 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  56.5 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  52.04 
 
 		 209 aa  209  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  54 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  54 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  56.19 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  54 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  56.19 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  54.55 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  54 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  53.77 
 
 		 199 aa  208  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  52.55 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  53.33 
 
 		 199 aa  208  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  51.81 
 
 		 197 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  53.96 
 
 		 203 aa  207  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  47.5 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  54.04 
 
 		 193 aa  204  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  49 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  49.25 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  53.57 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  48 
 
 		 200 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  50.75 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  53.09 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  53.61 
 
 		 192 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 192 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 192 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 192 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  53.61 
 
 		 192 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  50.25 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  53.06 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  53.89 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  53.61 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  51.49 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  53.93 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>