More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1240 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  100 
 
 
206 aa  414  1e-115  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.11 
 
 
203 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.57 
 
 
203 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  59.79 
 
 
201 aa  219  2e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.04 
 
 
203 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  57.98 
 
 
201 aa  214  6e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  57.98 
 
 
201 aa  214  6e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53 
 
 
202 aa  211  5e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.26 
 
 
206 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.11 
 
 
202 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.82 
 
 
197 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.68 
 
 
204 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.98 
 
 
201 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.94 
 
 
205 aa  199  2e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  57.07 
 
 
201 aa  198  4e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.26 
 
 
212 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.8 
 
 
208 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.8 
 
 
208 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.06 
 
 
195 aa  191  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.86 
 
 
204 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.5 
 
 
202 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  54.84 
 
 
202 aa  189  3e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  51.34 
 
 
208 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50.25 
 
 
213 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.03 
 
 
182 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  49.49 
 
 
202 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
201 aa  185  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  48.24 
 
 
203 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 
207 aa  181  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  51.35 
 
 
202 aa  181  8e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.06 
 
 
198 aa  181  9e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.95 
 
 
214 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.95 
 
 
214 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.27 
 
 
198 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.32 
 
 
209 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.37 
 
 
232 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50 
 
 
217 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.37 
 
 
232 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.27 
 
 
198 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.8 
 
 
207 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.46 
 
 
216 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50.54 
 
 
216 aa  174  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  48.91 
 
 
216 aa  174  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.89 
 
 
203 aa  174  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.41 
 
 
215 aa  173  1e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 
232 aa  172  2e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.01 
 
 
206 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  46.81 
 
 
203 aa  171  6e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  46.81 
 
 
203 aa  171  8e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  46.81 
 
 
203 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  46.81 
 
 
203 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  50.82 
 
 
202 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.53 
 
 
207 aa  168  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.07 
 
 
211 aa  164  1e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.5 
 
 
207 aa  155  5e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  2.37921e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.86 
 
 
199 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
199 aa  150  9e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 
204 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  42.86 
 
 
201 aa  147  1e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  5.99695e-06 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.93 
 
 
204 aa  146  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  42.86 
 
 
201 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  42.86 
 
 
201 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  41 
 
 
213 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.41 
 
 
199 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  42.86 
 
 
201 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  42.36 
 
 
201 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.86 
 
 
201 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  40.5 
 
 
194 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  42.36 
 
 
201 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.36 
 
 
201 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 
199 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.5 
 
 
199 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 
204 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  41.09 
 
 
197 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  39 
 
 
199 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 
203 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.06 
 
 
193 aa  141  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  41.38 
 
 
201 aa  140  2e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  41.18 
 
 
197 aa  139  4e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.8989e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.39 
 
 
199 aa  138  5e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.26863e-05  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  44.02 
 
 
201 aa  138  5e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.69 
 
 
202 aa  138  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.09 
 
 
213 aa  137  8e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  44.02 
 
 
201 aa  137  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  44.02 
 
 
201 aa  137  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  44.02 
 
 
201 aa  137  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  44.02 
 
 
201 aa  137  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.09 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  41.38 
 
 
201 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  39.9 
 
 
201 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  41.38 
 
 
201 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  41.38 
 
 
201 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  40.39 
 
 
201 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39 
 
 
206 aa  134  1e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 
200 aa  133  1e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  133  1e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  37.13 
 
 
197 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  9.50602e-08 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 
207 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  37.93 
 
 
201 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>