More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1224 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  100 
 
 		 415 aa  823    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 391 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 429 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  38.17 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  35.62 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  34.38 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  34.38 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  37.98 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 394 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  35.82 
 
 		 399 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  36.78 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  39.22 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  36.49 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  36.49 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  36.49 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  34.74 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  34.74 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  34.74 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  34.74 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  34.74 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  34.74 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  34.74 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>