More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1222 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  100 
 
 
272 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  61.76 
 
 
269 aa  331  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  53.18 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  52.43 
 
 
261 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  40.75 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
271 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
226 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
226 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.92 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.75 
 
 
250 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.56 
 
 
253 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
255 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.46 
 
 
262 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.22 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  29.92 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
210 aa  112  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  29.13 
 
 
248 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.41 
 
 
155 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  27.94 
 
 
249 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.11 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  44.34 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.52 
 
 
244 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.73 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  29.61 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  32.4 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  30.07 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
280 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
212 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.04 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  44 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.2 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.16 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.07 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.5 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.35 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  33.85 
 
 
776 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.77 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.5 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  33.97 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.81 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.19 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.21 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.41 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.21 
 
 
231 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
264 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  28.87 
 
 
259 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.01 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.87 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.65 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.9 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.74 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.17 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.86 
 
 
218 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  38.14 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.9 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.17 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.55 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.29 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.6 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.11 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4465  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.47 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>