More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1150 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  72.29 
 
 
504 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  72.64 
 
 
501 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  71.37 
 
 
502 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  72.69 
 
 
502 aa  774    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  72.29 
 
 
504 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  100 
 
 
496 aa  1036    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  71.03 
 
 
498 aa  725    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  67.54 
 
 
502 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  72.84 
 
 
501 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  73.24 
 
 
501 aa  755    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  82.63 
 
 
512 aa  866    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  50.4 
 
 
511 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  49.7 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  50.1 
 
 
516 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  49.7 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  50.3 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  50.5 
 
 
511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  49.4 
 
 
518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  49.19 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  48.79 
 
 
505 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  50.8 
 
 
511 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  49.58 
 
 
509 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  50.52 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  50.52 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  50.52 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  50.52 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  50.52 
 
 
517 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  50.52 
 
 
522 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  48.79 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  48.79 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  50.52 
 
 
517 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  47.47 
 
 
510 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  49.9 
 
 
517 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  47.69 
 
 
502 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  47.89 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  48.74 
 
 
513 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  47.7 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  46.37 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  47.48 
 
 
503 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  47.61 
 
 
515 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  45.77 
 
 
501 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  45.09 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  47.28 
 
 
594 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  43.54 
 
 
503 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  32.44 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  31.62 
 
 
476 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  31.78 
 
 
489 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.78 
 
 
474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  28.48 
 
 
535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  26.89 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  30.13 
 
 
497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.21 
 
 
473 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  26.92 
 
 
497 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.21 
 
 
549 aa  144  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.16 
 
 
497 aa  144  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.16 
 
 
497 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.16 
 
 
497 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.16 
 
 
497 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.34 
 
 
499 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  28.4 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.94 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.16 
 
 
497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  28.22 
 
 
481 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  32.09 
 
 
480 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  27.93 
 
 
572 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.91 
 
 
493 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.6 
 
 
523 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.16 
 
 
519 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  26.43 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.72 
 
 
496 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.51 
 
 
499 aa  133  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.27 
 
 
519 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.32 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.77 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.08 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.22 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  28.03 
 
 
517 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.25 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  25.43 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.21 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  29.28 
 
 
497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  26.79 
 
 
514 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.27 
 
 
479 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.15 
 
 
586 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  27.53 
 
 
508 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  27.52 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  28.08 
 
 
518 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.62 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  26.81 
 
 
483 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  27.17 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.41 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.21 
 
 
494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.35 
 
 
537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.85 
 
 
489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.09 
 
 
565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  27.11 
 
 
489 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  26.29 
 
 
501 aa  116  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.32 
 
 
486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3271  sulfatase  27.29 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755541  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  23.84 
 
 
512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>